STUDIU PE BAZĂ DE EVALUARE PRE-SCREENING
În desfășurare
CONTEXT
În contextul creșterii numărului de infectări cu varianta Omicron la nivel mondial, Centrul European de Prevenire și Control al Bolilor (ECDC) a recomandat statelor membre implementarea unor strategii de pre-screening a genomului virusului SARS-CoV-2 pentru variantele care determină îngrijorare la nivel mondial, așa cum este și Omicron.
În acest sens, MedLife continuă demersurile de cercetare și evaluează prin metoda pre-screening PCR probele COVID-19 pozitive din propriile laboratoarele, în vederea identificării indiciilor de infecție cu tulpina Omicron. Probele care, în urma evaluării pre-screening, ridică suspciuni de infecție cu tulpina Omicron se pretează pentru secvențiere ulterioară.
ETAPA I
Perioada de desfășurare
Decembrie 2021
Eșantion:
197 de probe COVID-19 pozitive, selectate în mod aleatoriu, de la pacienți din București, Timișoara, Cluj, Brașov, Arad, Craiova, Târgu Jiu și Târgu Mureș.
CONCLUZII ETAPA I
1 Nu au fost identificate suspiciuni de Omicron pe lotul studiat.
Pe lotul de 197 de probe analizate aleatoriu în decurs de 2 săptămâni nu au fost identificate suspiciuni de Omicron care s-ar putea preta pentru secvențiere ulterioară. Cu toate acestea, specialiștii explică faptul că acest lucru nu înseamnă că tulpina Omicron nu circulă pe teritoriul României ci că, probabil, încă nu are o răspândire comunitară largă.
2 Numărul de cazuri COVID-19 și implicit, de infectări cu tulpina Omicron va crește accelerat în perioada imediat următoare.
Date fiind rata mare de transmitere a noii tulpini și fluxul de români care se întorc în țară cu ocazia sărbătorilor de iarnă, specialiștii anticipează o creștere abruptă a numărului de infectări în perioada imediat următoare. Vaccinarea, respectarea măsurilor impuse de autorități și a măsurilor de protecție rămân singurele soluții pentru a tempera efectele valului 5 al pandemiei.
* Până la momentul transmiterii rezultatelor etapei I, în România erau confirmate 16 cazuri cu varianta Omicron a virusului SARS-CoV-2.
ETAPA II
Perioada de desfășurare:
Decembrie 2021
Eșantion:
85 de probe COVID-19 pozitive, alese aleatoriu din 8 orașe mari
CONCLUZII ETAPA II
1 30 de cazuri de infectare cu Omicron din 85 de probe COVID pozitive analizate
Pe lotul de 85 de probe studiat în această etapă, pe baza probelor alese aleatoriu din 8 orașe mari, specialiștii MedLife au identificat un număr de 30 de cazuri suspecte de infectare cu tulpina Omicron. Probele cu noua tulpină sunt din București (14), Cluj (8), Timișoara (4) și Brașov (4). Dată fiind distribuția relativ uniformă a probelor identificate cu Omicron în cele 4 orașe mari, se poate vorbi deja despre o transmitere comunitară.
Totodată, faptul că mai mult de o treime din probele analizate sunt cu noua tulpină confirmă rapiditatea cu care se răspândește această variantă și anunță o creștere iminentă a numărului de cazuri de COVID în perioada următoare.
2 Tulpina Omicron are șanse să devină dominantă în 2-3 săptâmini, având o rată de transmitere de 3 ori mai mare.
Dacă tulpina britanică a devenit dominantă în 4-5 săptămâni pe teritoriul României, tulpina Omicron ar putea deveni dominantă într-un timp mai scurt, dat fiind faptul că este mai contagioasă comparativ cu Delta. Deși anticipează o perioadă dificilă, specialiștii spun că există șanse ca valul 5 al pandemiei să fie mai scurt decât cel generat de Delta.
* Până la momentul transmiterii rezultatelor etapei II, în România erau confirmate 43 cazuri cu varianta Omicron a virusului SARS-CoV-2.
ETAPA III
Perioada de desfășurare
Ianuarie 2022
Eșantion
175 de probe COVID-19 pozitive, alese aleatoriu din mai multe orașe din țară
CONCLUZII ETAPA III
1 Numărul cazurilor suspecte în urma evaluării pre-screening s-a dublat în doar o săptămână
Alte 137 de cazuri suspecte de infectare cu tulpina Omicron au fost identificate de specialiștii MedLife în urma analizării unui nou lot de 175 de probe COVID pozitive. Numărul suspiciunilor este mai mult decât dublu, de la 35%, pe lotul analizat cu o săptămână în urmă, la 78%, pe lotul analizat în această săptămână. Aceste cifre confirmă, o dată în plus, rata mare de transmisibilitate a tulpinii Omicron.
Probele suspecte provin din: Cluj – 68, București – 37, Timiș – 22 și Brașov – 10.
2 Evaluarea pre-screening oferă indicii destul de precise: din cele 30 de cazuri suspecte identificate săptămâna trecută, 28 au fost confirmate cu noua tulpină în urma secvențierii.
Pe lotul analizat în etapa a II-a au fost identificate 30 de cazuri cu probabilitate de infectare cu Omicron, dintre acestea 28 fiind confirmate cu noua tulpină în urma secvențierilor, ceea ce confirmă un nivel ridicat de precizie a evaluării pre-screening.
Până la momentul transmiterii rezultatelor etapei a III-a, autoritățile au anunțat 295 de cazuri de infectare cu varianta Omicron a virusului SARS-CoV-2.
ETAPA IV
Perioada de desfășurare
Ianuarie 2022
Eșantion
349 de probe COVID-19 pozitive, alese aleatoriu din mai multe orașe mari din țară
CONCLUZII ETAPA IV
1 Tulpina Omicron a acaparat marile orașe. În Cluj se înregistrează cea mai mare pondere a cazurilor suspecte – 96%, în timp ce în București și Timișoara ponderea probelor suspecte este de peste 70%.
Din 349 de probe analizate în această etapă, 274 prezintă suspiciune de infectare cu tulpina Omicron, ceea ce reprezintă o pondere de 79% din lotul analizat. Ponderea cea mare de cazuri suspecte analizate per județ vine din Cluj (96% ), urmată de Timișoara (73%) și București / Ilfov (72%). Au mai fost identificate cazuri suspecte în județele Gorj, Alba, Bistrița Năsăud, Maramureș și Satu Mare.
Specialiștii anunță că deși tulpina Delta nu a dispărut în totalitate, Omicron pare a fi responsabil de creșterea abruptă a îmbolnăvirilor, în special în orașele mari, având o rata de transmitere mai mare comparativ cu varianta anterioară. În plus, spre deosebire de Delta, tulpina Omicron este caracterizată și de o rată de reinfectare mai mare în rândul vaccinaților și a celor trecuți prin boală.
2 Toate cazurile suspecte identificate în etapa anterioară prin pre-screening au fost confirmate cu Omicron în urma secvențierii.
Reprezentanții MedLife anunță că indiciile oferite de metoda de evaluare pre-screening sunt confirmate și de secvențiere. Astfel, toate cele 137 de cazuri suspecte identificate pe lotul anterior studiat au fost confirmate cu noua tulpină prin secvențiere.
În perioada decembrie 2021 – ianuarie 2022 MedLife a analizat prin metoda pre-screening PCR aproximativ 850 de probe COVID-19 pozitive în vederea detectării cazurilor suspecte de Omicron, probele suspecte fiind supuse procesului de secvențiere pentru confirmare fermă.